Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR44Q5JSH3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms