Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms