Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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RNF212Q495C1 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RNF212Q495C1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RNF212Q495C1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RNF212Q495C1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RNF212Q495C1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RNF212Q495C1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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RNF212Q495C1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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RNF212Q495C1 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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