Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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