Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms