Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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