Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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