Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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