Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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