Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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