Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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