Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms