Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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