Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GAPVD1Q14C86 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
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