Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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CHD4Q14839 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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CHD4Q14839 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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CHD4Q14839 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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CHD4Q14839 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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CHD4Q14839 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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