Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAPQ14761 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms