Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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