Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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