Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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