Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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