Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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