Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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MKRN3Q13064 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
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