Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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FOXI1Q12951 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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FOXI1Q12951 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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FOXI1Q12951 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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FOXI1Q12951 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
FOXI1Q12951 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
FOXI1Q12951 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
FOXI1Q12951 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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FOXI1Q12951 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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FOXI1Q12951 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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FOXI1Q12951 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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FOXI1Q12951 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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FOXI1Q12951 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXI1Q12951 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXI1Q12951 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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FOXI1Q12951 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXI1Q12951 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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