Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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FOXF1Q12946 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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FOXF1Q12946 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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FOXF1Q12946 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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FOXF1Q12946 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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