Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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TRAF2Q12933 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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TRAF2Q12933 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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TRAF2Q12933 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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TRAF2Q12933 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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TRAF2Q12933 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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TRAF2Q12933 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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TRAF2Q12933 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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TRAF2Q12933 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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TRAF2Q12933 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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