Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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