Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms