Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 DSTNP1-201ENST00000419906 465 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms