Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms