Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms