Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms