Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms