Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms