Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX1P78414 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms