Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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