Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms