Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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SPCS3P61009 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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SPCS3P61009 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPCS3P61009 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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