Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CLDN2P57739 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CLDN2P57739 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CLDN2P57739 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CLDN2P57739 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CLDN2P57739 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CLDN2P57739 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CLDN2P57739 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms