Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BACE1P56817 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BACE1P56817 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BACE1P56817 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BACE1P56817 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BACE1P56817 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BACE1P56817 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BACE1P56817 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BACE1P56817 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms