Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB28P51157 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB28P51157 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB28P51157 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB28P51157 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB28P51157 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB28P51157 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB28P51157 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB28P51157 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB28P51157 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB28P51157 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB28P51157 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB28P51157 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB28P51157 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB28P51157 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB28P51157 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB28P51157 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB28P51157 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms