Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms