Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJA4P35212 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJA4P35212 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJA4P35212 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJA4P35212 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJA4P35212 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJA4P35212 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJA4P35212 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJA4P35212 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJA4P35212 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJA4P35212 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJA4P35212 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJA4P35212 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJA4P35212 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJA4P35212 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJA4P35212 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJA4P35212 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJA4P35212 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJA4P35212 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJA4P35212 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJA4P35212 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms