Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA10P31260 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA10P31260 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA10P31260 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA10P31260 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA10P31260 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA10P31260 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA10P31260 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA10P31260 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA10P31260 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA10P31260 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA10P31260 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA10P31260 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA10P31260 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA10P31260 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA10P31260 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA10P31260 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA10P31260 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA10P31260 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA10P31260 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA10P31260 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA10P31260 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA10P31260 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA10P31260 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms