Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD27P26842 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD27P26842 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD27P26842 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD27P26842 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CD27P26842 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD27P26842 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD27P26842 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD27P26842 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD27P26842 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD27P26842 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD27P26842 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD27P26842 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD27P26842 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD27P26842 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD27P26842 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms