Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO1P25800 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms