Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms