Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms