Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPREP23469 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPREP23469 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPREP23469 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPREP23469 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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