Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
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PTPRAP18433 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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PTPRAP18433 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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PTPRAP18433 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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PTPRAP18433 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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PTPRAP18433 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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PTPRAP18433 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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PTPRAP18433 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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PTPRAP18433 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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PTPRAP18433 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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PTPRAP18433 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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