Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DESP17661 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DESP17661 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DESP17661 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DESP17661 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DESP17661 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DESP17661 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DESP17661 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DESP17661 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DESP17661 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DESP17661 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DESP17661 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DESP17661 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DESP17661 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DESP17661 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DESP17661 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DESP17661 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DESP17661 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DESP17661 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DESP17661 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DESP17661 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DESP17661 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DESP17661 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DESP17661 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DESP17661 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DESP17661 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DESP17661 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DESP17661 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DESP17661 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DESP17661 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DESP17661 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms